MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 1690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014911	GC	3	6	48767	48772	0 %	0 %	50 %	50 %	319765117
1002	NC_014911	ATG	2	6	48778	48783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765117
1003	NC_014911	TTC	2	6	48790	48795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765117
1004	NC_014911	CGC	2	6	48813	48818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765117
1005	NC_014911	GC	3	6	48830	48835	0 %	0 %	50 %	50 %	319765117
1006	NC_014911	CGC	2	6	48852	48857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765117
1007	NC_014911	GC	3	6	48939	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
1008	NC_014911	CTG	2	6	49021	49026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765118
1009	NC_014911	GC	3	6	49031	49036	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
1010	NC_014911	AAG	2	6	49052	49057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765118
1011	NC_014911	GC	3	6	49094	49099	0 %	0 %	50 %	50 %	319765118
1012	NC_014911	CCG	2	6	49161	49166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765118
1013	NC_014911	TAC	2	6	49177	49182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765118
1014	NC_014911	GCA	2	6	49190	49195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765118
1015	NC_014911	ACA	2	6	49208	49213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765118
1016	NC_014911	AAG	2	6	49338	49343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765119
1017	NC_014911	CGC	2	6	49385	49390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1018	NC_014911	GCC	2	6	49437	49442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1019	NC_014911	TGA	2	6	49457	49462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765119
1020	NC_014911	CAG	2	6	49469	49474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1021	NC_014911	ACT	2	6	49582	49587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1022	NC_014911	GC	3	6	49785	49790	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1023	NC_014911	CGG	2	6	49852	49857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1024	NC_014911	CACG	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	319765119
1025	NC_014911	TGC	2	6	49975	49980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1026	NC_014911	CGG	2	6	50012	50017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1027	NC_014911	GCG	2	6	50032	50037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1028	NC_014911	GGT	2	6	50069	50074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765119
1029	NC_014911	CTTCAT	2	12	50162	50173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319765119
1030	NC_014911	AAG	2	6	50214	50219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765119
1031	NC_014911	AGA	2	6	50227	50232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765119
1032	NC_014911	CTT	2	6	50240	50245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765119
1033	NC_014911	GGC	2	6	50315	50320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1034	NC_014911	TGG	2	6	50344	50349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765119
1035	NC_014911	CGGC	2	8	50350	50357	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1036	NC_014911	TAC	2	6	50358	50363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1037	NC_014911	GGC	2	6	50405	50410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1038	NC_014911	GCCG	2	8	50530	50537	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1039	NC_014911	TCA	2	6	50539	50544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1040	NC_014911	CTG	2	6	50565	50570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1041	NC_014911	CGC	2	6	50623	50628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1042	NC_014911	CAT	2	6	50756	50761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1043	NC_014911	CGC	2	6	50762	50767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1044	NC_014911	CGGC	2	8	50836	50843	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1045	NC_014911	CG	3	6	50847	50852	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1046	NC_014911	GCC	2	6	50889	50894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1047	NC_014911	GCGCA	2	10	51012	51021	20 %	0 %	40 %	40 %	319765119
1048	NC_014911	GCG	2	6	51058	51063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1049	NC_014911	CG	3	6	51062	51067	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1050	NC_014911	TGA	2	6	51220	51225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765119
1051	NC_014911	TGC	2	6	51253	51258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1052	NC_014911	CCG	2	6	51269	51274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1053	NC_014911	GC	3	6	51281	51286	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1054	NC_014911	TCA	2	6	51307	51312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1055	NC_014911	TGC	2	6	51382	51387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1056	NC_014911	CG	3	6	51554	51559	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1057	NC_014911	TAC	3	9	51600	51608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765119
1058	NC_014911	GCC	2	6	51622	51627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1059	NC_014911	TCG	2	6	51667	51672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
1060	NC_014911	CCA	2	6	51697	51702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765119
1061	NC_014911	TGGC	2	8	51747	51754	0 %	25 %	50 %	25 %	319765119
1062	NC_014911	AAG	2	6	51830	51835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765120
1063	NC_014911	CCG	2	6	51846	51851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765120
1064	NC_014911	CG	3	6	51855	51860	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1065	NC_014911	CGC	2	6	51866	51871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765120
1066	NC_014911	CGG	2	6	51889	51894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765120
1067	NC_014911	CCG	2	6	51895	51900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765120
1068	NC_014911	CG	3	6	51931	51936	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1069	NC_014911	GCG	2	6	51960	51965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765120
1070	NC_014911	GTGG	2	8	52031	52038	0 %	25 %	75 %	0 %	319765120
1071	NC_014911	GCC	2	6	52112	52117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765120
1072	NC_014911	CGC	2	6	52162	52167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765120
1073	NC_014911	GC	4	8	52188	52195	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1074	NC_014911	GC	3	6	52327	52332	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1075	NC_014911	GTGG	2	8	52402	52409	0 %	25 %	75 %	0 %	319765120
1076	NC_014911	CG	3	6	52416	52421	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1077	NC_014911	GC	4	8	52459	52466	0 %	0 %	50 %	50 %	319765120
1078	NC_014911	CTAC	2	8	52473	52480	25 %	25 %	0 %	50 %	319765120
1079	NC_014911	ACC	2	6	52502	52507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765120
1080	NC_014911	AAC	2	6	52523	52528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765120
1081	NC_014911	CGTG	2	8	52543	52550	0 %	25 %	50 %	25 %	319765120
1082	NC_014911	CCA	2	6	52589	52594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765121
1083	NC_014911	GAA	2	6	52596	52601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765121
1084	NC_014911	GCT	2	6	52627	52632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765121
1085	NC_014911	CCCT	2	8	52642	52649	0 %	25 %	0 %	75 %	319765121
1086	NC_014911	GCC	2	6	52657	52662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765121
1087	NC_014911	CGA	2	6	52668	52673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765121
1088	NC_014911	CAA	2	6	52692	52697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765121
1089	NC_014911	GC	3	6	52725	52730	0 %	0 %	50 %	50 %	319765121
1090	NC_014911	TCGCCA	2	12	52736	52747	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319765121
1091	NC_014911	GC	3	6	52823	52828	0 %	0 %	50 %	50 %	319765121
1092	NC_014911	AGC	2	6	52829	52834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765121
1093	NC_014911	GCG	2	6	52955	52960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765121
1094	NC_014911	TCA	3	9	52979	52987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765121
1095	NC_014911	CCG	2	6	53034	53039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765121
1096	NC_014911	TCGCA	2	10	53062	53071	20 %	20 %	20 %	40 %	319765121
1097	NC_014911	ACA	2	6	53165	53170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765121
1098	NC_014911	TC	3	6	53202	53207	0 %	50 %	0 %	50 %	319765121
1099	NC_014911	CAT	2	6	53277	53282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765121
1100	NC_014911	GCA	2	6	53301	53306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765121
1101	NC_014911	GGC	2	6	53344	53349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765121
1102	NC_014911	CGA	3	9	53358	53366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765121
1103	NC_014911	GGA	2	6	53483	53488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319765121
1104	NC_014911	TC	4	8	53509	53516	0 %	50 %	0 %	50 %	319765122
1105	NC_014911	GCT	2	6	53519	53524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765122
1106	NC_014911	CGCCCT	2	12	53525	53536	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319765122
1107	NC_014911	CGG	2	6	53543	53548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765122
1108	NC_014911	ACC	2	6	53556	53561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765122
1109	NC_014911	CAG	2	6	53601	53606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765122
1110	NC_014911	GCA	2	6	53627	53632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765122
1111	NC_014911	GC	3	6	53655	53660	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
1112	NC_014911	CCT	2	6	53741	53746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765122
1113	NC_014911	CGGC	2	8	53758	53765	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
1114	NC_014911	CGG	2	6	53788	53793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765122
1115	NC_014911	CCA	2	6	53815	53820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765122
1116	NC_014911	GGC	2	6	53832	53837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765122
1117	NC_014911	CAAT	2	8	53906	53913	50 %	25 %	0 %	25 %	319765122
1118	NC_014911	GCCG	2	8	53954	53961	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
1119	NC_014911	AAG	2	6	54043	54048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765123
1120	NC_014911	CGTC	2	8	54054	54061	0 %	25 %	25 %	50 %	319765123
1121	NC_014911	CAA	2	6	54066	54071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765123
1122	NC_014911	CGG	2	6	54090	54095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765123
1123	NC_014911	CTG	2	6	54100	54105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765123
1124	NC_014911	TCGT	2	8	54106	54113	0 %	50 %	25 %	25 %	319765123
1125	NC_014911	CGG	2	6	54134	54139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765123
1126	NC_014911	CG	3	6	54142	54147	0 %	0 %	50 %	50 %	319765123
1127	NC_014911	CGG	2	6	54164	54169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765123
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1375	NC_014911	ACCG	2	8	64213	64220	25 %	0 %	25 %	50 %	319765134
1376	NC_014911	GCCAG	2	10	64319	64328	20 %	0 %	40 %	40 %	319765134
1377	NC_014911	GTC	2	6	64333	64338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765134
1378	NC_014911	TCG	2	6	64366	64371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765134
1379	NC_014911	CGT	2	6	64412	64417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765134
1380	NC_014911	GCAG	2	8	64477	64484	25 %	0 %	50 %	25 %	319765134
1381	NC_014911	GCC	2	6	64496	64501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765134
1382	NC_014911	CGG	2	6	64737	64742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765134
1383	NC_014911	TCA	2	6	64744	64749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765134
1384	NC_014911	GTAG	2	8	64775	64782	25 %	25 %	50 %	0 %	319765134
1385	NC_014911	GGCCG	2	10	64812	64821	0 %	0 %	60 %	40 %	319765134
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1393	NC_014911	CGG	2	6	65318	65323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765135
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1396	NC_014911	ATC	2	6	65441	65446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765135
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1399	NC_014911	CG	3	6	65592	65597	0 %	0 %	50 %	50 %	319765135
1400	NC_014911	TCAC	2	8	65601	65608	25 %	25 %	0 %	50 %	319765135
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1479	NC_014911	ATCA	2	8	68715	68722	50 %	25 %	0 %	25 %	319765137
1480	NC_014911	CGA	2	6	68747	68752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765137
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1482	NC_014911	CGCT	2	8	68790	68797	0 %	25 %	25 %	50 %	319765137
1483	NC_014911	GC	3	6	68849	68854	0 %	0 %	50 %	50 %	319765137
1484	NC_014911	GAAG	2	8	68864	68871	50 %	0 %	50 %	0 %	319765137
1485	NC_014911	GAC	2	6	68959	68964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765137
1486	NC_014911	GCC	2	6	69096	69101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765138
1487	NC_014911	AC	3	6	69199	69204	50 %	0 %	0 %	50 %	319765138
1488	NC_014911	TCA	2	6	69250	69255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765138
1489	NC_014911	CCG	3	9	69334	69342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765138
1490	NC_014911	CGC	2	6	69365	69370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765138
1491	NC_014911	CG	5	10	69432	69441	0 %	0 %	50 %	50 %	319765138
1492	NC_014911	GGC	2	6	69450	69455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765138
1493	NC_014911	CCG	2	6	69472	69477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765138
1494	NC_014911	GGC	2	6	69497	69502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765138
1495	NC_014911	GATC	2	8	69692	69699	25 %	25 %	25 %	25 %	319765139
1496	NC_014911	GCA	2	6	69711	69716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765139
1497	NC_014911	GCCG	2	8	69790	69797	0 %	0 %	50 %	50 %	319765139
1498	NC_014911	GC	3	6	69858	69863	0 %	0 %	50 %	50 %	319765139
1499	NC_014911	TCGG	2	8	69952	69959	0 %	25 %	50 %	25 %	319765140
1500	NC_014911	TGG	2	6	69962	69967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765140

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